دانشگاه ملایر در راستای نیل به اهداف آموزشی و پژوهشی خود و انجام رسالت خطیر بعنوان نهاد دانش محور اقدام به توسعه و تجهیز امکانات آموزشی، آزمایشگاهها و کارگاههای خود نموده است. در همین راستا هم اکنون دانشگاه ملایر  دارای 22 آزمایشگاه و 7 کارگاه است. این مجموعه هم اکنون جهت استفاده تحقیقاتی در دسترس اعضای هیات علمی، دانشجویان دکتری، کارشناسی ارشد و کارشناسی دانشگاه ملایر است و قابلیت سرویس دهی به محققان و دانشجویان سایر مراکز را نیز دارد. دستگاه های مورد استفاده در این آزمایشگاه ها از محل خریدهای ارزی به میزان 800000 یورو و خریدهای نمایشگاهی سال92 به میزان 200 میلیون تومان بودجه اختصاص یافته به این آزمایشگاه ها، خریداری و نصب  و در حال استفاده می باشند.

از این مجموعه می توان به آزمایشگاه مرکزی شهید فرهاد توسکی که درسال 89 افتتاح شده است و بخش مهمی از فعالیت های آزمایشاهی را پوشش می دهد اشاره نمود. این آزمایشگاه هم اکنون دارای دستگاههای پیشرفته فعالی از جمله اتمیک ابزوربشن، اتمیک تک لامپی، دستگاه xrd , hplc ، سانتریفیوژ یخچالدار 1800 دور، دستگاه CG , سوکسله، دستگاه سنجش ضرایب فیزیکی محصولات کشاورزی ،دیپ فریزر 70 درجه، ژرمیناتور 600 لیتری و امکانات پیشرفته زیادی جهت انجام امور تحقیقاتی است.